ฝ่ายวิชาการ มีหน้าที่ดำเนินการจัดพิมพ์เอกสารการสอนชุดวิชาใหม่ ชุดวิชาปรับปรุง และชุดวิชาพิมพ์ซ้ำทุกระดับปริญญาตรี ปริญญาโท และปริญญาเอก ตลอดจนเอกสารต่าง ๆ ของมหาวิทยาลัยทั้งหมด และมีภารกิจด้านการคัดสรรตำราหรือเอกสารทางวิชาการที่มีคุณค่ามาจัดพิมพ์และเผยแพร่สู่สังคมให้กว้างขวางสำนักพิมพ์ มีบทบาทในการผลิตเอกสารการสอนชุดวิชา และสิ่งพิมพ์ต่าง ๆ ของมหาวิทยาลัย โดยเป็นกระบวนการก่อนพิมพ์ตั้งแต่รับต้นฉบับจากบรรณาธิการชุดวิชามาดำเนินการจนเสร็จสมบูรณ์ เริ่มจากงานเตรียมต้นฉบับชุดวิชา งานบรรณาธิการรูปเล่มเอกสารการสอน งานพิสูจน์อักษรชุดวิชา งานออกแบบภาพประกอบ งานออกแบบปกชุดวิชา และงานจัดหน้าอาร์ตเวิร์กเอกสารการสอนชุดวิชา ทั้งนี้มีการประสานกับบรรณาธิการชุดวิชาของคณะกรรมการกลุ่มผลิตและปรับปรุงเอกสารการสอน (คบ.ช.) เพื่อให้เป็นสื่อการสอนทางไกลที่มีคุณภาพ ตลอดจนรับผิดชอบงานพิมพ์ซ้ำสื่อสิ่งพิมพ์และจัดทำสื่ออิเล็กทรอนิกส์ e-Book เพื่อให้บริการระบบสื่อการศึกษา มหาวิทยาลัยสุโขทัยธรรมาธิราช STOU e-Book และเลือกสรรผลงานทางวิชาการที่หายากและมีคุณค่า ควรแก่การอนุรักษ์นำมาจัดพิมพ์เผยแพร่ไว้เป็นบริการทางวิชาการแก่นักศึกษาและสังคมทั่วไป นอกจากนั้นรับผิดชอบภารกิจสำคัญในการออกแบบและจัดหน้าสิ่งพิมพ์อื่นที่ไม่ใช่เอกสารการสอนของมหาวิทยาลัย เช่น ข่าวสาร หนังสือเล่ม โปสเตอร์ แผ่นพับ แบบฟอร์ม ระเบียบการฯ คู่มือนักศึกษา ฯลฯ โดยแบ่งโครงสร้างการบริหารงานออกเป็น 7 หน่วย ดังนี้
1. หน่วยเลือกสรรหนังสือ 5. หน่วยจัดหน้าชุดวิชา
2. หน่วยเตรียมต้นฉบับ 6. หน่วยศิลปะ
3. หน่วยบรรณาธิการ 7. หน่วยพิสูจน์อักษร
4. หน่วยพิมพ์ซ้ำชุดวิชา